用于检测仔猪致病菌的23S rRNA基因芯片的研制

作者：伍诚意; 曹峰子; 梁之昶; 章振华; 杨兵; 周宏专; 季海峰; 陈小玲

来源：中国兽医科学, 2010, (03): 258-264.

DOI：10.16656/j.issn.1673-4696.2010.03.008

• 仔猪
• 致病菌
• 23S rRNA基因
• 芯片
• 寡核苷酸探针 piglet
• pathogenic bacteria
• 23S rRNA gene
• microarray
• oligonucleotide probe

以副猪嗜血杆菌、胸膜肺炎放线杆菌、多杀性巴氏杆菌、大肠杆菌、肠道沙门氏菌、猪链球菌等12种仔猪致病菌为目标细菌,23SrRNA基因为靶基因,从GenBank中下载其23SrDNA全序列,在其变异区设计特异性探针,在保守区设计通用引物。通过序列分析、PCR靶标与探针杂交试验,建立了有13条寡核苷酸探针和2对通用引物的仔猪常见致病菌基因芯片检测方法。以参考菌株粗提基因组DNA的10倍系列稀释模板做PCR,扩增产物与探针杂交,检出芯片的灵敏度为100fg。对33个参考菌株用芯片检测,结果有1例不正确,只鉴定到属;在61个野外分离株中,55株的芯片检测结果与生化或测序结果一致,有6例不一致,符合率为9...

• 单位
  北京市农林科学院; 河北农业大学; 首都师范大学; 江西生物科技职业学院