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摘要
四氢嘧啶(Ectoine)是由细菌产生的一种次级代谢产物,赋予细菌抵御高渗透压环境的一种相容性溶质。研究显示许多细菌具有四氢嘧啶基因簇(ect ABCD-ask),然而关于该基因簇在假单胞菌属(Pseudomonas)中的分布还没有系统报道。鉴于此,以公共数据库中已测序的9 548株假单胞菌属菌株全基因组序列为数据,采用深度生物信息学分析方法探究假单胞菌中的四氢嘧啶基因簇分布及其组成共线性特征。结果显示165株假单胞菌携带有四氢嘧啶基因簇,占假单胞菌株总数的1.78%,归属于32个不同的种,超过一半的菌株属于施氏假单胞菌(P.stutzeri);同一种内菌株间,ect ABCD-ask及其侧翼基因高度保守,共线性水平程度高。系统地揭示了假单胞菌基因组中四氢嘧啶基因簇分布规律,将为开展生物合成四氢嘧啶提供重要菌种资源信息。
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单位凯里学院; 复旦大学
