基于复合系统协同度模型,利用2008—2017年粤港澳大湾区相关数据,分析其科技创新协同发展状况,进一步运用多维正态云模型,分析2017年区域内各地科技创新水平差距。结果表明,粤港澳大湾区科技创新复合系统的协同度有所提升,目前处于低度协同发展状态,协同度上升速率不稳定,协同化进程较慢;区域内部科技创新结构不合理,各地科技创新水平等级跨度大,呈阶梯式不均衡状态。