P-PARV4全基因组克隆及序列分析

作者：陈芯羽; 刘钟元; 孙文超; 赵翠青; 白杰英; 李昌; 刘立明^*

来源：中国兽医学报, 2023, 43(06): 1139-1144.

DOI：10.16303/j.cnki.1005-4545.2023.06.03

• 猪hokovirus
• 猪细小病毒4型
• 系统发育演化

为研究广西地区猪hokovirus(PHoV)又称猪PARV4 (P-PARV4)毒株流行情况和遗传进化特征，对采自广西地区猪组织样品进行检测，扩增出其中1株全基因序列，命名为YL172(GenBank登录号：KX827773)。感染率调查结果显示，广西地区成年猪P-PARV4感染率为95.0%。同源性分析结果显示，P-PARV4 YL172株全基因组与喀麦隆、欧洲、美国和中国参考株同源性为96.1%～99.3%;YL172株NS1基因与参考株同源性为97.0%～99.5%;YL172株VP2基因与参考株同源性为93.4%～99.1%。VP2遗传进化分析结果显示，P-PARV4分离株存在2个亚群，YL172株与中国参考株GX1、SH1、JSNJ处在同一进化分支，而美国参考株US-HK133与HK1则处在另一进化分支。

• 单位
  吉林农业科技学院; 中国农业科学院; 动物科技学院; 北京大学; 中国医学科学院; 温州大学