滇黄精转录组测序及类黄酮合成相关基因的分析

作者：肖韵铮; 韩世明^*; 秦昭; 李春奇^*

来源：河南农业大学学报, 2020, 54(06): 931-940.

DOI：10.16445/j.cnki.1000-2340.2020.06.004

• 滇黄精
• 转录组
• 类黄酮
• 差异基因

为了丰富滇黄精不同器官发育的转录组数据,筛选参与类黄酮生物合成的关键基因,对滇黄精根、茎和叶进行转录组测序,并对参与类黄酮生物合成的差异基因进行筛选分析。转录组测序共获得219 769条unigenes,平均长度502.31 bp,N50为627 bp。通过数据库(NR、eggNOG、Pfam、Swiss-Prot、KEGG、GO、KOG、COG)对unigenes进行功能基因注释,分别有76 179、67 055、45 508、35 287、26 259、39 479、43 295和24 524条unigenes获得注释。基于转录组测序分析,筛选出10个与滇黄精类黄酮生物合成相关的差异基因,通过qRT-PCR检测差异基因在滇黄精不同器官中的表达水平,并与类黄酮含量进行相关性分析,确认CHI和CHS是滇黄精类黄酮生物合成途径中的关键基因,其基因的表达量决定了类黄酮的合成量。

• 单位
  河南农业大学; 生命科学学院; 六盘水师范学院