缺氧诱导人胰腺星状细胞活化过程中基因甲基化谱分析

作者：张晓云; 袁玥; 金桐; 卢迪; 刘心娟; 郝建宇^*

来源：中华消化杂志, 2023, 43(06): 406-410.

DOI：10.3760/cma.j.cn311367-20221223-00636

• 胰腺炎, 慢性
• 缺氧
• 胰腺星状细胞
• DNA甲基化
• 差异基因

采用简并代表性亚硫酸氢盐测序技术, 对缺氧诱导人胰腺星状细胞(PSC)活化过程中的基因甲基化谱进行分析。PSC低氧培养24 h后, 细胞基因组较常氧培养细胞的平均甲基化率上升;差异甲基化区域共1 754个(971个高甲基化, 783个低甲基化)。基因本体论分析显示, 启动子区差异甲基化基因的功能主要富集于凋亡的半胱氨酸型内肽酶抑制活性、金属肽酶活性、质膜外侧、细胞外泌体、丝裂原活化蛋白激酶级联途径、染色体分离等条目;京都基因与基因组百科全书通路分析显示, 差异基因主要参与癌症通路、肌动蛋白细胞骨架的调节、肾上腺素能信号、昼夜节律夹带、胰岛素信号通路等。

• 单位
  首都医科大学附属北京朝阳医院