提出一种计算大直径深水圆柱结构所受动水力的时域算法。大直径深水圆柱结构动水压力计算中,需要考虑水体的可压缩性。基于解析方法推导了频域动水力公式,该公式在时域计算中需要进行快速傅里叶变换或者时间卷积运算,计算量巨大。采用由频域有理函数近似和时域辅助变量实现构成的时间卷积算法,将动水力的频域解析公式实现为高精度、高效率时域算法。算例表明,本文方法具有较高的计算精度和计算效率。