新城疫病毒F基因重要功能区和HN基因单核苷酸多态性研究

作者：张晓东; 刘怀然; 刘培欣; 刘胜旺; 孔宪刚

来源：中国家禽, 2010, (16): 14-17.

DOI：10.16372/j.issn.1004-6364.2010.16.018

• 新城疫病毒
• F基因
• HN基因
• 单核苷酸多态性
• 选择压力 Newcastle disease virus
• F gene
• HN gene
• single nucleotide polymorphism
• selection pressure

对广泛应用的新城疫疫苗株La Sota进行了全基因组测序,并对来自9个不同基因型新城疫病毒株的血凝素神经氨酸酶(haemagglution-neuraminidase,HN)基因和融合蛋白(fusion protein,F)基因47～435 nt区域进行了用单核苷酸多态性(SNP)分析。结果表明:在F基因47～435 nt间和HN基因中都存在高密度的SNP位点,Tajima′s D检验结果表明这些核苷酸变化符合中性突变假说,Pi(a)/Pi(s)分析暗示F蛋白编码基因N端的一些区段和HN蛋白编码基因中散在的部分区域受到了正向选择,但F基因和HN基因在整体上却都受到了强大的负向选择压力的影响。

• 单位
  中国农业科学院哈尔滨兽医研究所; 兽医生物技术国家重点实验室