胃癌免疫基因组学分型及其特征研究

作者：王尧; 巴宏军; 柳子川; 周旻; 周启明^*

来源：现代医院, 2020, 20(06): 891-894.

DOI：10.3969/j.issn.1671-332X.2020.06.030

• 胃癌
• 基因组学
• 免疫分型
• 免疫检查点抑制剂
• CIBERSORT

目的通过基因组学分析建立胃癌免疫分型,并进一步探讨其免疫特征。方法从TCGA数据库下载443例胃癌患者的基因表达谱及生存数据,通过单样本基因集富集分析(ssGSEA)评分对患者进行分组;采用ESTIMATE及CIBERSORT分别评估各样本中免疫微环境及免疫细胞的组成;采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线并对组间差异进行Log-rank检验。结果根据免疫评分将患者分为高、中、低免疫组,三组间预后具有统计学差异;高免疫组所包含的免疫细胞和基质细胞数量最多,肿瘤纯度最低; HLA基因及PD-L1、PD-L2、PIK3CA表达明显增高;高免疫组中CD8+T细胞含量最高,而M0巨噬细胞和幼稚B细胞最少。结论胃癌免疫分型有助于判断患者的预后,高免疫组患者具有较高的免疫原性及抗肿瘤免疫活性。

• 单位
  广州医科大学附属肿瘤医院; 华中科技大学; 中山大学附属第一医院