云南省2014年1株肠道病毒71型B5亚型病毒全基因组序列分析

作者：周晓芳; 向以斌; 姜黎黎; 徐闻; 寸建萍^*

来源：中国病毒病杂志, 2019, 9(04): 256-262.

DOI：10.16505/j.2095-0136.2019.0051

• 手足口病
• 肠道病毒71型
• B5亚型
• 全基因组
• 云南省

目的对2014年云南省监测的1株手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)肠道病毒71型(enterovirus 71,EV-A71)B5基因亚型分离株进行全基因组序列分析。方法对收集到的手足口病病例粪便标本进行病毒分离培养和鉴定,对鉴定为EV-A71型B5亚型的毒株全基因组进行分段核酸扩增PCR并测定序列,获得的各段序列通过SeqMan拼接后获得全基因组序列,并与其他参考株构建遗传进化树进行基因分析。结果获得该肠道病毒71型B5基因亚型分离株(J098/YN/CHN/2014)的全基因组序列(7 290bp),它与B5亚型毒株同源性最高(92.4%～98.0%),未发现基因重组情况,其VP1区氨基酸在多个位点上与其他基因型参考株存在特异突变。结论云南由EV-A71引起的手足口病仍以C4a亚型为主,但EV-A71B5亚型毒株的出现提示应密切关注其流行变异情况,为今后手足口病的公共卫生策略提供依据。

• 单位
  云南省疾病预防控制中心