肌营养不良小鼠关键基因和通路的生物信息学分析

作者：廖子钰; 李欢; 王倞; 林金福; 张成^*

来源：中风与神经疾病杂志, 2021, 38(06): 496-500.

DOI：10.19845/j.cnki.zfysjjbzz.2021.0133

• 杜兴型肌营养不良症
• mdx鼠
• 关键基因
• 信号通路
• 生物信息学

目的对杜兴型肌营养不良症动物模型mdx鼠的关键基因和通路进行分析,探索mdx鼠的发病机制,为DMD的潜在治疗靶点研究奠定基础。方法从GEO (Gene Expression Omnibus)数据库中筛选纳入GSE7187、GSE64418和GSE52766数据集,分别筛选出3个数据集中的mdx鼠的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),对3个数据集中重合的DEGs进行基因本体论分析、富集信号通路分析和蛋白质网络互作分析并筛选出10个网络重要节点作为关键基因。结果 3个数据集共同的DEGs有68个,其中61个基因表达上调,7个基因表达下调。GO分析发现DEGs主要与免疫系统过程有关,KEGG分析发现DEGs参与了与炎症反应和免疫反应相关的通路。Tyrobq、Emr1、C1qb、Ly86、C1qc、C1qa、Lyz2、Ms4a6d、Fcer1g和Fcgr3是mdx鼠的关键基因。结论 mdx鼠发病与免疫反应和炎症反应有关,本研究筛选出的关键基因提示了DMD新的治疗靶点。

• 单位
  中山大学附属第一医院