桑黄菌丝体转录组SNP/Indel位点分析

作者：王晖; 付春正; 温晴; 昝程; 张东豪; 陈秀灵; 宋永学^*

来源：北方蚕业, 2023, 44(02): 6-10.

DOI：10.19443/j.cnki.1673-9922.2023.02.007

• 桑黄
• 转录组
• 单核苷酸多态性
• 插入缺失
• 分布规律

通过对不同生长状态桑黄菌丝体进行转录组测序，分析SNP/Indel位点的分布和特征。结果表明，桑黄菌丝体的GC含量范围在不同的生长状态下变化不大，且处于51.38%～52.32%。共有6 244个基因检测到SNP/Indel位点，4 031个基因含有41 663个SNP位点；5 922个基因检含有22 813个Indel位点，5 756个基因检测到20 164个插入位点，1 852个基因检测到2 649个缺失位点。SNP类型以转换为主，密码子第一位碱基出现SNP位点的数目最多，包含1个SNP位点的基因数最多，为有848个。缺失类型以3 bp、4 bp的类型最多，插入类型以1 bp的类型最多。1 402个基因在KEGG数据库获得功能注释。上述结果表明，桑黄转录组SNP/Indel位点数量多、类型多样，为桑黄种质资源鉴定等提供参考。

• 单位
  承德医学院