乳腺癌细胞中的基因转录暂停现象研究

作者：陈子清; 王治; 张长青^*; 王进^*

来源：金陵科技学院学报, 2021, 37(03): 86-92.

DOI：10.16515/j.cnki.32-1722/n.2021.03.014

• 转录暂停
• 新生RNA
• 生物信息学
• 乳腺癌

为揭示基因转录暂停机制在乳腺癌发生中的作用,利用生物信息学方法鉴定了人乳腺上皮细胞和6种乳腺癌上皮细胞中的转录暂停基因,分析了转录暂停基因的表达变化和管家基因的暂停分布。结果表明:1)癌细胞中暂停基因占比较高,基因转录暂停程度与其表达量呈负相关。2)转录暂停的基因倾向于在核糖核蛋白复合物生物合成和RNA剪接等通路中富集,癌细胞中的管家基因同样发现有大量活跃的转录暂停基因。3)暂停位置附近显著富集KLF5、NRF1、ELK4 3种转录因子的结合位点。上述研究为认识细胞癌变的发生提供了基因转录暂停的全组学分子基础,有助于全面和深入认识癌症发生的分子机制。

• 单位
  生命科学学院; 金陵科技学院; 南京大学