基于CRISPR/dCas9-SAM系统筛选胃癌细胞增殖相关基因

作者：彭玉; 巩琦凡; 台福敏; 王田田; 葛常辉; 郑晓飞; 秦宜德^*; 付汉江^*

来源：安徽医科大学学报, 2022, 57(11): 1693-1698.

DOI：10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2022.11.003

• CRISPR/dCas9-SAM系统
• 细胞增殖
• 胃癌
• 长链非编码RNA

目的 利用CRISPR/d Cas9-SAM系统探究影响胃癌细胞AGS增殖相关基因，分析其在胃癌发生发展中的作用。方法 针对胃癌与正常胃组织差异表达的基因设计sgRNA，构建包装后获得慢病毒文库。以该文库感染AGS细胞后不同时间点作为筛选压力，收取第0、7、14天3个时间点的AGS细胞。高通量测序分析感染后不同时间点AGS细胞中sgRNA富集情况，获得与AGS细胞增殖相关差异基因。结果生物信息学显示与0 d组相比，7 d组、14 d组分别获得阴性筛选差异基因42、45个，阳性筛选差异基因59、40个。其中7 d组和14 d组中阴性筛选和阳性筛选共有的基因各11个。结论 筛选获得11个抑制AGS细胞增殖的基因，其中5个为蛋白编码基因，6个为长链非编码RNA(lncRNA)基因;筛选获得11个促进AGS细胞增殖的候选基因，其中3个为蛋白编码基因，8个为lncRNA基因。为进一步功能验证、全面解析胃癌发生发展过程奠定基础。

• 单位
  基础医学院; 安徽医科大学