椰子ALDH基因家族的鉴定及生物信息学分析

作者:武映宏; 黄东益; 王永; 张大鹏; 刘蕊; 孙熹微; 肖勇*
来源:热带生物学报, 2022, 13(06): 541-549.
DOI:10.15886/j.cnki.rdswxb.2022.06.001

摘要

为了鉴定椰子的ALDH基因家族,分析其基因结构、保守结构域、系统发育树以及其表达模式,通过下载OsALDH基因家族的蛋白质序列,并与椰子的蛋白质的数据库进行比对,鉴定出12个CnALDH基因,分属于9个亚族。结果表明,ALDH编码的氨基酸等电点为5.35~8.68,多数分布在叶绿体中。表达谱分析结果显示,除CnALDH12_A1和CnALDH22_A1外,其他的CnALDH基因家族成员均在叶片中有高水平表达。而CnALDH10_A8在不同组织以及不同时期展现组成性表达,推测该基因参与椰子的一些基础性功能,是不可或缺的基因。

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