28株隐球菌ITS基因序列测定及其系统进化分析

作者：吴媛; 杜鹏程; 卢金星

来源：疾病监测, 2011, (02): 92-95.

• 隐球菌
• 转录间隔区
• 系统进化分析 Cryptococcus
• internal transcribed spacer
• phylogenetic analysis

目的测定28株鸽粪中分离的隐球菌的转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)序列,并根据ITS序列构建28株隐球菌和6株新生隐球菌的系统进化树。方法应用neighbor-joining(NJ)和m aximumparsimony(MP)方法构建系统进化树,研究隐球菌属不同菌种间的亲缘和进化分化关系。结果两种聚类方法得到的进化树模型基本一致,所有菌株聚类为3个主要分支:6株分离到的新生隐球菌和6株参考菌株为一支;大部分DHP和XSQ菌株聚为一支,除HP6外,所有的HP菌株和XSQ46-1及XSQ59-3,聚类为平行的第3个分支。从分化远近看,新生隐球菌分支、DH...

• 单位
  中国疾病预防控制中心传染病预防控制所; 传染病预防控制国家重点实验室