摘要
为了了解四川省成都地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus, PRRSV)流行毒株的分子生物学特性及遗传变异情况,试验采用生物信息学软件,对从四川省成都地区部分中小型养殖场猪群中收集的9份PRRSV阳性样品进行ORF5基因序列比对及遗传变异分析。结果表明:PCR扩增得到大小约为937 bp的条带,阳性克隆菌的测序结果与GenBank中PRRSV的同源性均大于98%;9株毒株SC20-13、SC20-19、SC20-27、SC20-31、SC20-35、SC20-76、SC20-81、SC20-95、SC21-11的ORF5基因核苷酸序列的同源性为84.4%~100%,其推导氨基酸序列的同源性为83.9%~100%。9株毒株均为PRRSV-2型,其中8株与谱系8的JXA1、CH-1a和CH-1R亲缘关系最近,而1株(SC21-11株)与谱系1的代表株NADC30的亲缘关系最近,SC21-11株GP5蛋白的第33位氨基酸缺失(S/N/G33)。说明PRRSV毒株变异频繁,GP5蛋白S/N/G33缺失模式可以演化成为一类新型ORF基因缺失NADC30-like毒株。
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单位四川省畜牧科学研究院; 四川省动物疫病预防控制中心; 西南民族大学