甘肃不同矿区样品中的细菌多样性

作者：王永刚^*; 王江勤; 罗文; 冷非凡

来源：基因组学与应用生物学, 2021, 40(03): 1187-1195.

DOI：10.13417/j.gab.040.001187

• 酸性矿坑水(AMD)
• 嗜酸菌
• 微生物多样性
• 高通量测序
• 功能预测

甘肃矿产资源丰富,矿区酸性矿坑水(acid mine drainage, AMD)及周边土壤中嗜酸微生物种类丰富,具有相当大的研究价值。本研究通过Illumina高通量测序方法,对甘肃省4个矿区AMD及周边土壤中的细菌群落组成、相似性及功能组成进行分析。结果表明,煤矿样品GNM细菌物种组成最为丰富,金矿样品LNJ1与紫金矿样品LNZJK细菌组成最相似,与属于铜矿的BYT物种较相近,与LNJ1同地区的LNJ2样品细菌组成相比较远。所有样品细菌主要分为放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteriodetes)、厚壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria)四大门,其中变形菌门(Proteobacteria)丰度最高。放线菌门(Actinobacteria)中不动杆菌属(Acinetobacter)、类诺卡氏属(Nocardioides)和芽球菌属(Blastococcus)表现出较高丰度;厚壁菌门(Firmicutes)中微小杆菌属(Exiguobacterium)和芽孢杆菌属(Bacillus)表现出较高丰度,且微小杆菌属(Exiguobacterium)丰度极高。通过功能预测发现,与煤矿样品GNM相比,LNJ1、LNJ2、BYT和LNZJK 4个金属矿区样品中的微生物具有较强的氨基酸与碳源的转运与代谢、转录等功能以及较低的能量生产与转运、无机离子转运与代谢能力。通过探究AMD中的细菌多样性及其与重金属之间的相互关系,了解AMD采样区微生物群落结构,以期挖掘出更为丰富的具有重金属抗性的菌株资源,以应用于生物浸矿和环境修复等领域。

• 单位
  兰州理工大学