基于SSR分子标记的蔓荆子基原植物的遗传多样性及遗传结构分析

作者：孙艺琦; 赵露颖; 朱波; 贾敏; 张巧艳^*; 秦路平^*

来源：中国中药杂志, 2021, 46(15): 3824-3831.

DOI：10.19540/j.cnki.cjcmm.20210522.101

• 蔓荆子
• 遗传多样性
• SSR分子标记

该文旨在阐明蔓荆子基原植物的遗传多样性与遗传结构,并对蔓荆子野外种质资源的保护提供相应策略及保护居群,以此为蔓荆子的可持续利用提供理论依据。运用8对SSR分子标记分析了蔓荆子基原植物19个居群共232个个体的单叶蔓荆与蔓荆群体的遗传多样性与遗传结构。利用Popgene32、GenAlex 6.502、STRUCTURE等软件对单叶蔓荆及蔓荆的遗传多样性、遗传结构进行分析,并对个体数量大于10的种群进行瓶颈效应检测。研究结果显示单叶蔓荆与蔓荆居群分别检测到42、26个等位基因,平均期望杂合度分别为0.448 6、0.583 9,揭示单叶蔓荆与蔓荆具有较低的遗传多样性。AMOVA分析发现单叶蔓荆与蔓荆群体遗传变异主要存在于居群内(84.43%,P<0.01;60.37%,P<0.01)。哈温平衡检验结果发现8个SSR位点中,单叶蔓荆居群2个位点符合哈温平衡,其余6个位点全部为显著不平衡(P<0.05),蔓荆居群2个位点显著不平衡(P<0.05),提示居群曾经历过瓶颈效应。Mantel test检测显示,单叶蔓荆与蔓荆居群间的遗传变异在一定程度上受到地理距离的影响,但影响不大。主成分分析与STRUCTURE分析显示各个居群之间基因渐渗现象较为明显。蔓荆子基原植物具有低水平的遗传多样性及遗传分化,因此,应加强对蔓荆子野生资源的保护,以确保其种质资源的可持续利用。

• 单位
  中国人民解放军第二军医大学; 浙江中医药大学