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摘要
对光叶子花叶绿体基因组特征进行分析，探究其与近缘种之间的系统发育关系。本研究通过NCBI数据库，下载已公布的石竹目(Caryophyllaceae)12个种的叶绿体基因组序列，以秘鲁叶子花叶绿体基因组作为参考，通过Genious中的MAFFT软件进行序列比对，并利用生物信息学手段进行特征分析。结果显示：光叶子花叶绿体基因组长度为154 763 bp, LSC区长度为85 921 bp, SSC区长为18 018 bp,一对IR区均长25 412 bp,呈典型的四分体结构。注释基因有131个，蛋白编码基因86个，tRNA基因37个还有8个rRNA基因，平均GC含量为36.4%。利用MISA软件在紫茉莉科9个种的叶绿体基因组中共检测到605个SSR,重复类型中以单核苷酸最多582个，占总SSR的96.2%。重复基元最多的是A/T,572个，占比94.5%。紫茉莉科不同物种的叶绿体基因组IR边界区的基因类型和基因分布情况存在一定差异，但相对比较保守。紫茉莉科9个种叶绿体基因组之间检测到6个高变区，rps16-trnQ、rps4-trnL、ndhC-trnV、rps3-rpl22、ndhF-rpl32和ycf1。系统发育分析表明，光叶子花和叶子花在亲缘关系上关系最近。
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