茶树C4H基因的克隆及生物信息学分析

作者：汪文俊; **山; 罗纪军; 朱林; 吴琼; 谢婷; 宗凯; 余晓峰^*

来源：中国口岸科学技术, 2022, 4(11): 91-96.

• 茶树
• C4H基因
• 生物信息学分析

克隆验证茶树肉桂酸-4-羟基化酶（cinnamate 4-hydroxylase,C4H）基因并预测C4H基因的生物学功能。提取茶树新鲜叶片总RNA，利用逆转录-聚合酶链反应克隆出茶树C4H基因，利用生物信息学软件分析C4H基因编码蛋白质的保守结构域、理化性质、亚细胞定位、跨膜域和信号肽、同源性、系统进化等。结果表明：茶树C4H基因包含一个1518 bp的完整开放阅读框（open reading frame,ORF），编码505个氨基酸；保守结构域分析显示，茶树C4H基因编码的蛋白包含一个p450超家族蛋白的结构域（PLN02394），分子量为58.16 kDa，理论等电点为9.29，为亲水性的不稳定蛋白质，定位在内质网，无信号肽，不含有跨膜结构域，以α-螺旋和无规则卷曲为主构成其蛋白二级结构，C4H基因在氨基酸水平与油茶树同源性最高（92%）。本研究成功克隆了茶树C4H基因，分析了其生物学功能，为进一步深入研究C4H基因的功能及茶树合成的分子机理奠定了初步的理论基础。

• 单位
  黄山小罐茶业有限公司; 合肥海关技术中心