本发明公开了一种基于自适应灰狼算法的频率选择表面设计方法及系统,该方法针对频率选择表面结构优化问题,以频率选择表面在中心工作频率的滤波效果作为目标,建立了以节点为基础的频率选择表面单元优化模型,然后采用自适应灰狼算法与模型结合进行求解,并基于该方法开发了频率选择表面设计系统;与传统的FSS优化方法相比,本发明具有更大的优化范围且克服了传统FSS设计效率低、质量差和依赖经验等缺陷,通过本发明实现FSS单元从设计需求到成品的自动化设计,提高了FSS的设计效率。