为适应于当下社会经济发展的需求及科技活动发展规律,落实财政科研院所科学化、精细化管理要求,合理配置科技资源,国家陆续出台了一系列文件,不断优化科研项目间接费用的管理。本文分析了现阶段科研院所科研项目间接费用在财务管理方面存在的问题,并提出了相应的对策,以加强间接费用的核算与财务管理,提高间接费用的使用效益。