广西合浦珠母贝3个不同群体遗传关系分析

作者：邹杰; 彭慧婧; 郑德斌; 张守都^*

来源：水产科学, 2023, 42(03): 466-473.

DOI：10.16378/j.cnki.1003-1111.21103

• 合浦珠母贝
• 杂交
• 单核苷酸多态
• 遗传分化
• 长纯合片段

为探索广西合浦珠母贝群体内杂交组合方式，分别从北海野生群体(F1)、选育群体(F4)和养殖群体中随机挑选2龄种贝样本15个，进行简化基因组测序，通过单核苷酸多态标记解析3个群体的遗传关系。研究结果显示，获得超过585 000个单核苷酸多态标记，野生群体、选育群体和养殖群体的观测杂合度分别为0.1975、0.1679和0.1783,期望杂合度分别为0.2545、0.2469和0.2732,平均近交系数分别为0.2075、0.3449和0.3465,多态信息含量分别为0.2032、0.2089和0.2241,选育群体近交系数与养殖群体相近，野生群体和养殖群体的群体遗传多态高于选育群体。系统进化树和主成分分析显示，选育群体与养殖群体部分样品亲缘关系较近。选育群体和养殖群体之间的遗传分化指数最低，部分亲本同源的可能性较大；野生群体、选育群体和养殖群体的平均长纯合片段数分别为59.1、49.5个和56.6个，长纯合片段平均长度分别为0.312、0.313 Mb和0.311 Mb,平均单核苷酸多态标记含量分别为59、50和73,近交系数FROH分别为0.0149～0.0240、0.0159～0.0201和0.0170～0.0246,反映3个群体的真实近交水平较低；野生群体、选育群体和养殖群体的整个染色体内连锁不平衡衰减距离分别为0.4、0.4 kb和0.2 kb(r2=0.2),衰减速度为养殖群体>野生群体>选育群体，选育群体衰减速度最慢，可能与人工选育有关。以上结果表明，广西合浦珠母贝可采用野生群体×选育群体或野生群体×养殖群体的杂交组合方式开展群体内杂交。本研究结果可为广西合浦珠母贝育种中的亲本选择提供参考。

• 单位
  广西海洋研究所有限责任公司; 广西科学院; 天津渤海水产研究所