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摘要
ATP合酶是光合作用中光合磷酸化和呼吸作用氧化磷酸化的关键酶，可以催化合成ATP.利用生物信息学分析糠椴ATP合酶基因的同源性、开放阅读框、氨基酸组成、蛋白质亲/疏水性、蛋白质跨膜结构域、氨基酸二级结构，利用同源建模构建糠椴ATP合酶三维结构，MEGA7构建糠椴ATP合酶不同亚基基因系统进化树.结果表明：糠椴ATP合酶由atpA、atpB、atpE、atpF、atpH和atpI等6个亚基组成，每个亚基基因序列相似度达到100%的物种各不相同，且不同亚基的基因序列长度和氨基酸组成差异较大.其中，atpA、atpB、atpE和atpF为亲水性蛋白，atpH和atpI为疏水性蛋白.atpI的跨膜区最多，atpA、atpB和atpE不存在跨膜结构.糠椴ATP合酶由51.40%的α螺旋、13.10%的β折叠和35.50%的无规则卷曲组成，其中，atpF和atpH仅由α螺旋和无规则卷曲组成，无β折叠.糠椴atpA、atpB、atpE、atpF和atpI亚基基因与粉椴、少脉椴和紫椴亲缘关系较近.研究结果可为糠椴ATP合酶的基因克隆提供参考.
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