水仙内生真菌的分离鉴定及聚类分析

作者：杨明俊; 李娟; 王永刚; 薛鸿燕; 马雪青; 杨林

来源：中草药, 2014, 45(11): 1625-1630.

• 水仙
• 内生真菌
• 分离
• 鉴定
• 聚类分析

目的分离纯化水仙根茎中的内生真菌,并进行菌群组成及其多样性分析。方法采用表面消毒、划线法从水仙鳞茎和根中分离内生真菌,基于形态学特征和核糖体转录间隔区(ITS-rDNA)序列分析,对分离株进行分类鉴定;以内生真菌的多样性指数(H)和均匀度指数(E)为指标,分析水仙内生真菌的菌群组成及其多样性。结果共分离到18株内生真菌,其中16株来自根部,2株来自鳞茎,分别占总分离菌株的88.89%和11.11%。PCR扩增其中14株真菌ITS-rDNA,得到大小约500 bp片段,用BLAST软件对其测序结果进行相似性比对,发现4株为青霉属Penicillium,相似性95%99%;3株为曲霉属Aspergillus,相似性99%100%;3株为喙枝孢属Rhinocladiella,相似性为99%;其他4株分别为木霉属Trichoderma、链格孢属Alternaria、赤霉属Gibberella和镰孢霉属Fusarium,相似性都为99%。青霉菌为水仙内生真菌优势菌属。通过构建系统发育树发现这14株内生菌明显分为2大类群,Shannon多样性指数为1.778,均匀度为0.913 7。结论水仙内生真菌菌群组成具有一定程度的多样性和差异性。

• 单位
  家畜疫病病原生物学国家重点实验室; 兰州理工大学; 中国农业科学院兰州兽医研究所