我国部分新型布尼亚病毒分离株全基因组序列分析

作者：刘秀兰; 姚学君; 张雪峰^*; 管书慧; 姜仁杰^*

来源：江苏预防医学, 2018, 29(06): 623-648.

DOI：10.13668/j.issn.1006-9070.2018.06.005

• 新型布尼亚病毒
• 全基因组
• 序列分析
• GenBank数据库

目的分析我国新型布尼亚病毒分离株全基因组序列,了解遗传进化特点。方法利用DNA STAR和MEGA6.0软件,对GenBank数据库收录的我国75株分离株全基因组序列进行分析,构建系统进化树,并对毒株核苷酸和氨基酸突变位点进行统计。结果 75株新型布尼亚病毒分离株流行优势株为基因型C;分离株核苷酸碱基突变总数合计5 938bp,主要为碱基转换(占79.86%);氨基酸间突变总数合计3 304aa。结论我国新型布尼亚病毒全基因组序列系统进化树具有相似的拓补结构。

• 单位
  江苏省疾病预防控制中心