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摘要
为了开发火焰兰(Renanthera coccinea)的SSR引物，进而开展海南岛火焰兰的种质鉴定、遗传多样性和群体结构分析。本研究采用三代测序技术首先获得火焰兰参考转录组，然后开发了火焰兰的SSR引物，最后基于SSR引物利用分子变异分析(AMOVA)、非加权组平均法(UPGMA)聚类、主坐标(PCoA)与群体结构分析等方法对来自海南岛不同地理分布的396份火焰兰资源进行研究。结果表明，所开发的17对三核苷酸多态性SSR引物能够有效地鉴别所收集的396份火焰兰种质。AMOVA分析显示，火焰兰群体间呈现极高程度的遗传分化，并且群体内的遗传变异高于群体间的遗传变异。群体结构分析显示，来自不同地理分布的海南岛火焰兰存在3个不同的基因库，而且绝大多数群体是独立进化的，只有少数群体存在遗传混合，这一结果与UPGMA和PCoA分析的结果基本一致。综上可知，本研究新开发的17对SSR引物有效鉴定了396份海南岛火焰兰种质，揭示了其遗传多样性和群体遗传结构，对火焰兰的种质资源保护和育种计划具有非常重要的参考价值。
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