平均血小板体积相关基因的富集分析

作者：徐颜美; 王立; 李静; 黄波; 刘静; 陈鑫; 陈希敏; 林晋; 黄林凤; 王小中

来源：临床检验杂志, 2014, 32(02): 90-94.

DOI：10.13602/j.cnki.jcls.2014.02.017

• 平均血小板体积
• 富集分析
• 易感基因

目的通过对平均血小板体积(MPV)相关的易感基因进行功能富集分析,为MPV的功能学研究提供理论指导。方法整合所有全基因组关联研究(GWAS)报道的MPV易感基因作为分析的靶基因集合,通过生物网络基因本体论分析工具(BiNGO)及网页版基因富集分析工具(WebGestalt)对靶基因集合进行功能富集分析,并对两个软件富集的结果进行比较和讨论。结果 MPV易感基因主要富集于止血、体液水平调节和血小板激活等生物学途径,并且在KEGG(京都基因和基因组百科全书)和Wiki通路数据库中共享细胞凋亡、补体凝固系统和黏着斑通路。结论用生物信息学分析工具对6篇GWAS发现的MPV易感基因进行功能富集分析,发现3条与MPV相关的重要通路,为MPV的功能学研究提供了重要的线索。

• 单位
  南昌大学第二附属医院; 南昌大学; 南昌大学第一附属医院; 第二临床医学院