毛果杨ITPK家族基因的鉴定及特性分析

作者：李新林; 金华^*; 邹吉祥; 金纯伊; 朱桐; 程文琼; 王铸; 樊家昊

来源：分子植物育种, 2019, 17(20): 6632-6638.

DOI：10.13271/j.mpb.017.006632

• 毛果杨(Populus trichocarpa)
• 1,3,4-三磷酸肌醇5/6激酶(ITPK)
• 生物信息学分析

1,3,4-三磷酸肌醇5/6激酶(ITPK)作为磷脂酰肌醇信号通路的一种重要的调控酶,在动物、植物、线虫的生物信号传导和生长发育中起到重要作用。为了进一步对毛果杨中ITPK家族基因进行系统分析,利用毛果杨的基因组数据库,通过生物信息学方法,对毛果杨ITPK基因家族的基因结构、染色体位置、蛋白结构域、细胞定位预测、系统进化、基因表达进行了分析。结果表明:毛果杨中的ITPK家族基因共有6个成员,分布于毛果杨的6条染色上。进化树分析显示毛果杨ITPK基因可分为3个亚家族;基于保守域分析显示,Pt ITPK1～PtITPK5均含有3个保守结构域,Pt ITPK6只含有2个保守结构域;毛果杨ITPK基因在各个器官或组织中均有表达。研究结果为进一步克隆该家族基因与验证ITPK家族基因与生物逆境胁迫相关提供科学依据。

• 单位
  大连民族大学