鼠肠道病毒RT-PCR检测与基因序列分析

作者：胡群; 马思杰; 王军

来源：中国人兽共患病学报, 2018, 34(05): 416-419.

• 鼠类
• 肠道病毒属
• 一致-简并RT-PCR
• 系统发生分析

目的对鼠类携带的肠道病毒进行检测并分析病毒基因序列特征。方法设计肠道病毒属一致-简并引物,采用RT-PCR方法对宁波口岸捕获的鼠类肠道内容物样品进行检测,对PCR产物进行测序,并将所测序列与国内外肠道病毒属病毒株序列进行核苷酸同源性分析和构建种系进化树。根据基因序列比对结果,采用鼻病毒通用引物进行验证。结果共检测165份鼠类样品,2份黄毛鼠样品经检测为阳性,扩增片段大小为378bp,标识为DXEV1601。片段的系统发生分析显示DXEV1601与人鼻病毒1B SC9813株位于同一进化分支,与23个不同肠道病毒属病毒流行株同源性相似度范围为50.3%～59.6%。经鼻病毒特异性引物扩增为阳性。结论宁波地区野生鼠类中存在鼻病毒感染。