昆明裂腹鱼CYP1A1基因结构与进化分析

作者：毕映慧; 苗贵东^*; 杨申才; 吕彤彤; 杨进

来源：科技创新与生产力, 2023, (01): 26-33.

• 昆明裂腹鱼
• 细胞色素P450基因
• 基因结构
• 进化分析

通过构建昆明裂腹鱼全长转录组文库获得基因全长，并通过设计引物PCR扩增，验证高通量测序的准确性，同时对CYP1A1基因的CDS序列进行基因结构和生物信息学分析。结果表明：昆明裂腹鱼CYP1A1基因的CDS序列为1 498 bp，编码299个氨基酸，与鲤鱼、安水金线鲃、鲫鱼的CDS序列的同源性相似比率分别为91.70%、92.23%、91.63%，氨基酸序列同源性相似比率分别为90.55%、90.16%、89.76%，昆明裂腹鱼CYP1A1基因的氨基酸的相对分子质量为55 867.48 KD，理论等电点(pI)为6.44，分子式为C2505H3965N671O728S23；分子系统进化树分析表明，与金线鲃、犀角金线鲃和安水金线鲃亲缘关系相近，与斑马鱼亲缘关系较远；昆明裂腹鱼CYP1A1基因存在明显的疏水性区域，有1个信号肽、27个磷酸化位点、2个跨膜区、有1个N-糖基化位点，3个O-糖基化位点；二级结构主要以α-螺旋为主，无规则卷曲次之，β-折叠最少；三级结构分析表明，昆明裂腹鱼CYP1A1基因有1个缺失突变位点，6个Cys位点。该研究为进一步研究昆明裂腹鱼CYP1A1基因的功能奠定了基础。

• 单位
  兴义民族师范学院