乌苏里貉KIT基因及编码蛋白生物信息学分析

作者：白秀娟; 姜恩泽; 苏杭; 朱宇航; 许愿; 徐逸男; 李雪; 韩志强; 徐超

来源：东北农业大学学报, 2020, 51(07): 52-58.

DOI：10.19720/j.cnki.issn.1005-9369.2020.07.007

• KIT基因
• 乌苏里貉
• 蛋白质结构
• 生物信息学

KIT基因表达量通常与黑色素含量呈正比,通过3种毛色乌苏里貉KIT基因转录本定量表达分析发现,白貉KIT基因表达量较高,为探究乌苏里貉KIT基因及编码蛋白结构特性,使用基于机器学习和神经网络算法软件对其编码蛋白结构作全面生物信息学分析。结果表明,乌苏里貉KIT基因编码蛋白含有972个氨基酸,属于酸性亲水型蛋白,无规则卷曲为主要二级结构,存在两个跨膜区,细胞膜外侧存在信号肽,含有21个糖基位点,60个磷酸化位点,4个保守结构域,与5个蛋白密切作用,系统发育树构建结果与生物学分类一致。分析结果为进一步研究乌苏里貉KIT蛋白生物学特性奠定基础。

• 单位
  东北农业大学; 中国农业科学院特产研究所