基于生物信息学分析miR-30d-5p在注意缺陷多动障碍发病机制中的作用

作者：孙加雯; 张帆; 朱萍; 吴丽慧^*

来源：精神医学杂志, 2020, 33(02): 98-103.

• 注意缺陷多动障碍
• ADHD
• miR-30d-5p
• 靶基因
• 生物信息学

目的采用生物信息学方法分析miR-30d-5p在注意缺陷多动障碍(ADHD)发病机制中的作用。方法通过TargetScan7.2、miRDB和miRTarBase数据库预测miR-30d-5p的靶基因,利用Cytoscape 3.7.1软件中的ClueGO插件对靶基因进行GO和KEGG富集分析,同时通过Cytoscape 3.7.1软件中的STRING插件构建靶蛋白互作(PPI)网络并筛选出核心基因,通过与ADHD gene数据库中已验证的ADHD相关基因对比,分析miR-30d-5p在ADHD中的作用和意义。结果 GO富集显示miR-30d-5p靶基因定位到核质、细胞内细胞器、轴突、细胞膜等细胞结构,并在神经系统中广泛参与到神经元发育、分化、神经元发生的调节、神经元投射发育、顺式调控区结合及顺式调控区序列特异性DNA结合等生物过程。KEGG富集显示miR-30d-5p靶基因显著富集在FoxO信号通路、轴突导向、海马长时程增强和神经营养信号通路。NOTCH1、KRAS、SIRT1、MAPK8、SOCS3、NEDD4、SKP2、BDNF、NEDD4L、SOCS1为miR-30d-5p预测靶基因的PPI网络中的核心基因。与ADHD gene数据库对比结果显示miR-30d-5p预测靶基因有33个基因与ADHD相关,且33个基因中含有预测核心基因BDNF。结论 miR-30d-5p通过靶向调控BDNF基因参与ADHD发生发展的过程,miR-30d-5p有潜力成为ADHD诊疗相关的靶点。

• 单位
  浙江省人民医院; 蚌埠医学院