一株Ⅱ型草鱼呼肠孤病毒强毒株的分离鉴定及全基因组序列分析

作者:曾伟伟; 董寒旭; 杨映; 陈言峰; 于辉; 李华
来源:佛山科学技术学院学报(自然科学版), 2022, 40(01): 1-9.
DOI:10.13797/j.cnki.jfosu.1008-0171.2022.0001

摘要

目的 对一例典型草鱼出血病的病原进行分离、鉴定和全基因组序列分析。方法 采用细胞培养分离病毒、PCR检测和测序分析、电镜观察、间接免疫荧光(IFA)分析、全基因组序列测定及回归感染鉴定对采集的草鱼出血病样品进行病原分析。结果 接种病毒的细胞没有产生CPE,但电镜观察可见大量呈典型呼肠孤病毒特点的病毒粒子,PCR检测并测序分析和IFA鉴定表明该分离株为II型GCRV;分离的病毒感染草鱼可出现典型的草鱼出血病症状,最终死亡率为96.7%,暂命名为GD20-08株;全基因组测序表明,GD20-08的基因组结构Ⅱ型GCRV分离株的相似,其核苷酸和氨基酸序列其他Ⅱ型GCRV分离株的同源性分别在94%~99%和96%~100%不等。结论 从患草鱼出血病的草鱼体内分离到一株Ⅱ型GCRV的变异强毒株。

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