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摘要
通过分析芝麻叶绿体基因组密码子的使用偏性，阐明其密码子的使用偏性特征，并探讨其影响因素。以芝麻叶绿体基因组的50个蛋白编码序列为研究对象，利用CodonW等软件对其密码子使用模式及影响因素进行了分析。结果发现：芝麻叶绿体基因的GC含量平均为38.48%，密码子三个位置的GC含量平均值分别为47.22%、39.88%和28.33% (即GC1>GC2>GC3)；GC1和GC2相关性显著，但它们与GC3相关性都不显著；ENC值的范围从36.59到57.73，平均值为47.20，都高于35；密码子使用偏性受多种因素的影响，其中自然选择是主要影响因素；对应性分析发现，前4个轴为主要影响因素，总共代表了近70%的变异来源，但不同轴与密码子其它相关指标的相关性并不相同；高频密码子和最优密码子分析，共获得了32个高频密码子，16个最优密码子，这些密码子第3位碱基也都偏向于使用A或T（U）。本研究表明芝麻叶绿体基因组的密码子使用偏性较弱，其主要受到自然选择的影响，并且密码子第三位碱基多以A或T（U）结尾。
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