河北省 PEDV 流行毒株的分离鉴定及遗传演化分析

作者：辛树阳; 严世杰; 宋涛; 郝建香; 付琦媛; 李文傲; 王春芳; 回卫荣; 唐梦虎; 马增军; 芮萍^*

来源：中国兽医学报, 2020, 40(07): 1265-1271.

DOI：10.16303/j.cnki.1005-4545.2020.07.01

• 猪流行性腹泻
• 流行病学
• 遗传变异

为掌握河北省猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)的流行和变异情况,2017—2018年本研究在河北地区(秦皇岛、唐山、承德、张家口、廊坊、保定和石家庄)共收集278份疑似猪流行性腹泻(porcine epidemic diarrhea,PED)病死猪临床样品,采用RT-PCR技术进行PEDV筛查,共检测到53份阳性病料,阳性率为19.1%。通过Vero细胞传代培养,成功分离到1株PEDV毒株,将其命名为CH-HB1-2018,对其进行全基因组测序,结合GenBank中公布的PEDV毒株序列对其进行全基因序列同源性比对及系统进化树分析,结果显示所分离毒株与CV777,CH-S,SM98等早期经典毒株的核苷酸同源性在96.6%～97.6%之间,与2010年后分离的变异毒株JS-HZ2012,LC,JSX2014等的核苷酸同源性在98.9%～99.1%之间,进化树分析结果表明所分离毒株为变异毒株,与JS-HZ2012,JSX2014等变异毒株属于同一进化分支,与同源性分析结果一致。本研究为河北省PEDV的流行情况研究提供了理论依据。

• 单位
  河北科技师范学院