绿豆VrWOX基因家族鉴定及表达分析

作者：郭旭; 张慧莹; 王铮; 李帅^*

来源：生物工程学报, 2023, 39(02): 566-585.

DOI：10.13345/j.cjb.220684

• 绿豆
• VrWOX
• 基因家族
• 共线性分析
• 基因表达

WOX(WUSCHEL-related homebox)基因家族是植物特有的一类转录因子，是同源盒(homeobox,HB)转录因子超家族中的重要成员。WOX基因在植物干细胞调节及生殖发育过程中具有重要作用，其功能已在多个植物物种中鉴定。然而绿豆(Vigna radiate) VrWOX基因家族信息尚不清楚。本研究通过同源比对和聚类分析，在绿豆基因组中鉴定了42个VrWOX基因。VrWOX基因在绿豆染色体中分布不均，其中7号染色体含有的VrWOX数量最多。VrWOX基因分为古老进化支(19个VrWOX)、中等进化支(12个VrWOX)和年轻进化支(WUSCHEL进化支，11个VrWOX) 3个亚类。种内和种间共线性分析发现，VrWOX基因共有12个重复事件，与拟南芥(Arabidopsis thaliana)AtWOX有15个同源基因对，与菜豆(Phaseolus vulgaris) PvWOX有22个同源基因对。VrWOX基因在基因结构、保守基序等方面存在很大差异，因而可能存在功能差异。VrWOX基因启动子区域含有不同种类和不同数量的顺式作用元件，导致VrWOX基因在不同组织中表现出不同的基因表达模式。本研究对VrWOX基因家族信息和表达模式进行了分析，为绿豆VrWOX基因功能和调控网络的解析奠定了一定的理论依据。

• 单位
  青岛农业大学; 生命科学学院