基于生物信息学对心肌梗死与不稳定型心绞痛差异靶基因的研究分析

作者：伍燕宏; 何劲松; 杨小英; 张衒; 白法文; 郑景辉^*

来源：重庆医科大学学报, 2020, 45(12): 1780-1786.

DOI：10.13406/j.cnki.cyxb.002508

• 心肌梗死
• 不稳定型心绞痛
• 基因芯片
• 差异靶基因
• 生物信息学

目的:探究心肌梗死与不稳定型心绞痛的生物学机制,为后期临床研究提供航向。方法 :基于GEO数据库对基因芯片GSE29111进行挖掘,再利用GWAS数据库对差异靶基因进行二次筛选,最后进行生物信息学分析。结果 :运用GEO数据库GEO2R鉴定到的差异靶基因,有188个蛋白点表达有统计学差异(P<0.05);经GWAS数据库基因位点(gene/region)P值设定:-log10P≥3筛选与心肌梗死与不稳定型心绞痛相关的差异靶基因共7个,分别是MACF1、TANC2、PSMF1、CD59、MYO18B、GALNT10、TFPI。运用Metascape基因注释工具,发现这7个差异靶基因主要与蛋白水解的负调节、创伤愈合有关。运用David工具对这7个差异靶基因在线进行GO分析及KEGG分析发现,这些差异靶基因与内肽酶活性的负调控、凝血、肽链内切酶抑制剂活性、肌动蛋白结合和补体系统有关。结论:心肌梗死与不稳定型心绞痛差异靶基因主要与肽链内切酶抑制剂活性及补体系统相关联,主要调控的差异靶基因是CD59、TFPI。

• 单位
  广西中医药大学附属瑞康医院