河北省肾综合征出血热疫区鼠携带汉坦病毒基因特征分析

作者:蔡亚男; 魏亚梅; 韩旭; 韩占英; 刘世友; 张艳波; 齐顺祥; 李琦*
来源:中国病原生物学杂志, 2021, 16(05): 536-539.
DOI:10.13350/j.cjpb.210508

摘要

目的了解河北省肾综合征出血热(HFRS)疫区鼠携带汉坦病毒(HV)的基因特征。方法收集2019年河北省各地市捕获的鼠类标本,无菌下解剖取肺组织,应用Real-time PCR对阳性鼠标本进行HV G2片段扩增并测序,运用DNASTAR 7.1软件包对核苷酸序列进行同源性比较,采用MEGA 5.22软件构建系统发生树分析。结果共收集951份鼠肺标本,经Real-time PCR检测HV阳性标本共24份,均为汉城型(SEO)。对12份标本进行序列测定,鼠肺标本病毒间变异不大,同源性达97.3%~100.0%。新测序株与以往测序株比较同源性为97.3%~99.7%。系统发生树分析显示12份标本均为S3亚型HV。结论河北省HFRS疫区HV基因型以SEO型为主,亚型为S3亚型,同亚型病毒基因高度同源,无明显变异,遗传物质具有区域稳定性特征。

  • 单位
    河北省疾病预防控制中心

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