烟草周期蛋白依赖性激酶基因NtCDK8的克隆及生物信息学分析

作者：吴向伟; 王根洪; 聂梦云; 熊海军; 高军平; 谢小东; 夏庆友

来源：烟草科技, 2014, (10): 71-86.

• 烟草
• 周期蛋白依赖性激酶
• 基因克隆
• 生物信息学

为明确周期蛋白依赖性激酶(Cyclin-dependent protein kinases,CDKs)在烟草中的生物学功能,通过同源性搜索的方法获得了烟草周期蛋白依赖性激酶基因的EST序列。采用RT-PCR技术,从烟草栽培品种红花大金元中成功克隆出了周期蛋白依赖性激酶基因,并命名为NtCDK8。NtCDK8基因cDNA编码区全长为1422 bp,编码473个氨基酸。氨基酸序列同源性比对分析表明:NtCDK8蛋白与番茄、马铃薯、拟南芥周期蛋白依赖性激酶的相似性分别达到93.02%,94.08%和75.32%。蛋白结构预测分析显示NtCDK8具有丝氨酸/苏氨酸(Serine/Threonine)蛋白激酶结构域,可能通过促使下游蛋白中的丝氨酸或苏氨酸残基磷酸化,进而促使细胞外信号向细胞内传递;通过疏水性、信号肽及亚细胞定位预测综合分析表明,NtCDK8蛋白可能是一个在细胞核中发挥功能的亲水性蛋白。

• 单位
  西南大学; 家蚕基因组生物学国家重点实验室