2016年江苏省类猪圆环病毒P1分子流行病学回顾性调查

作者：盛少阳; 温立斌; 茅爱华; 朱雪姣; 李彬; 任子利; 何孔旺^*

来源：畜牧与兽医, 2019, 51(03): 97-100.

• 类猪圆环病毒P1
• 序列分析
• 江苏

旨在了解2016年江苏省类猪圆环病毒P1流行及毒株变异情况。运用PCR技术对江苏省9个县级市送检的330份血清进行检测,并进行全基因组测序,应用BioEdit和DNAStar对获得的P1全长基因组及ORF1与GenBank中的参考毒株进行序列比对及同源性分析,并进行系统进化树分析。共检出阳性样品43份,占总样品数的13%;9个地级市P1检出率差异显著,其中,沛县检出率最高为38.2%,其余各地0%～20%不等。选取9个县级市的代表毒株进行全基因组测序,共获得12株P1全长序列,12株毒株核苷酸同源性在99.4%～100%,ORF1核苷酸同源性在99.1%～100%;与参考毒株相比,ORF1核苷酸同源性在99.4%～100%,氨基酸同源性在99.1%～100%。研究表明,2016年江苏省各地区P1感染率差异显著,但整体感染率较高,毒株变异较小。

• 单位
  西藏农牧学院; 动物科技学院; 江苏省农业科学院