本发明公开了紫外杀菌净水器的微生物紫外剂量的测量方法。该方法通过仿真得出微生物随水流作用在紫外杀菌净水器内的流动轨迹;对轨迹采样获取系列坐标点、两采样点之间的时间间隔;通过辐照度分析得出空间各点紫外的辐照强度,与间隔时间相乘得到微生物两采样点间运动过程中获得的紫外辐照剂量;根据空间分布,选择轨迹线上采样点的数量及采样点的间隔,获得定量的整体有效剂量。本发明借助仿真手段,模拟微生物随水流运动轨迹、停留时间及其受紫外辐射强度的动态数值。