脊髓损伤后肌肉萎缩lncRNA-miRNA-mRNA调控网络的筛选及验证

作者：刘付春; 李筱璐; **青; 桂裕昌; 张寅炜; 许建文^*

来源：海南医学院学报, 2023, 1-10.

DOI：10.13210/j.cnki.jhmu.20230330.003

• 脊髓损伤
• 肌肉萎缩
• 生物信息学
• lncRNA-miRNA-mRNA
• WGCNA

目的：基于生物信息学分析挖掘脊髓损伤（spinal cord injury， SCI）后肌肉萎缩的关键靶点，构建lncRNA-miRNA-mRNA调控网络，通过动物实验验证关键调控网络在SCI后肌肉萎缩中的表达变化，为SCI后肌肉萎缩发病机制及治疗寻求新的研究方向。方法：从GEO数据库下载GSE21497数据集，进行差异表达基因筛选、WGCNA处理，再结合在线预测数据库筛选出关键mRNA，利用DAVID数据库对关键mRNA进行GO、KEGG富集分析，构建lncRNA-miRNA-mRNA调控网络，挑选出关键调控基因，然后采用RT-qPCR进行验证。结果：①共筛选出差异表达基因1 405个，结合WGCNA和在线数据库预测，共得到30个关键mRNA；②GO、KEGG富集分析发现其主要在神经元的再生、保护、信号传递等功能及HIF信号通路、PD-L1表达和PD-1检查点通路显著富集；③筛选出4个（LINC00410/miR-17-5p/KCNK10、LINC00410/miR-17-5p/PCDHA3、LINC00410/miR-20b-5p/KCNK10、LINC00410/miR-20b-5p/PCDHA3）关键调控网络；④RT-qPCR 实验结果显示，与对照组相比，观察组模鼠miR-17-5p、miR-20b-5p表达上升，KCNK10、PCDHA3表达下降。结论：miR-17-5p、miR-20b-5p、KCNK10、PCDHA3在神经元的再生、保护、信号传递可能具有重要的调控作用，有望成为SCI后肌肉萎缩诊疗及康复的新靶点。

• 单位
  广西中医药大学; 广西医科大学第一附属医院