一项中国幽门螺杆菌耐药基因型及菌株谱系的全基因组测序研究

来源：中华医学杂志, 2022, 102(22).

幽门螺杆菌(Helicobacter pylori, H. pylori)是胃癌Ⅰ类致癌物, 根除H. pylori能显著降低胃癌的发生率和死亡率。抗生素耐药是导致H. pylori根除治疗失败的最重要因素, 因此药敏指导下的个性化诊疗日益重要。为了加强对H. pylori耐药机制的了解, 并寻找新的耐药基因型位点, 该研究从中国幽门螺杆菌分子医学中心(CCHpMM)菌株库复苏了60株H. pylori, 进行了耐药表型检测和全基因组测序(whole genome sequencing, WGS), 并评价了耐药表型和基因型的一致性。结果显示克拉霉素和左氧氟沙星耐药基因型与表型几乎完全一致, Kappa系数分别为0.867和0.833。所有携带R16H/C突变和rdxA截断的H. pylori都具有甲硝唑耐药性, 特异性为100%。此外, 研究还发现HP0399基因的A1378G突变和FabH基因的A149G突变两个新位点, 可能分别导致了四环素耐药和多药耐药性。该研究结果表明, 用克拉霉素和左氧氟沙星耐药基因型检测耐药是可靠的, WGS对发现新的H. pylori耐药位点有很大帮助, 并为发现H. pylori新耐药机制提供了基础。