长江口邻近海域沉积物中好氧氨氧化细菌群落多样性

作者：路兴岚; 甄毓; 米铁柱; 杨官品; 于志刚; 陈阳阳

来源：海洋环境科学, 2013, 32(05): 641-646.

• 好氧氨氧化细菌
• 氨单加氧酶基因
• 长江口
• 沉积物 aerobic ammonium-oxidizing bacteria
• amoA
• Changjiang Estuary
• sediment

从长江口邻近海域沉积物中提取好氧氨氧化细菌(aerobic ammonium-oxidizing bacteria,AOB)的DNA,通过构建硝化作用氨单加氧酶基因文库并划分操作分类单元(OTU)的方法,揭示好氧氨氧化细菌群落结构多样性。结果显示,研究的两个站位(G6站和33站)分别获得417和428个amoA基因克隆,其序列皆属于变形杆菌的β-亚纲,但与此亚纲中已有明确分类信息菌株的amoA基因序列距离较远,相似度较低;利用DOTUR软件将相似度不小于97%的序列归为一个OTU,两站均得到11个OTUs,但离岸较近的G6站沉积物中β-AOB具有较高的多样性,而离岸较远的33站则多样性较低,且...

• 单位
  中国海洋大学; 上海市气候中心