苦荞FtHCT的基因克隆与生物信息学分析

作者：杨晓琳; 段迎; 蔡苏云; 贺润丽; 尹桂芳; 王艳青; 卢文洁; 孙道旺; 王莉花

来源：分子植物育种, 2021, 1-14.

• 苦荞
• HCT
• 基因克隆
• 生物信息学
• 表达分析

本研究克隆木质素生物合成途径关键酶莽草酸/奎宁酸羟基肉桂酰转移酶（HCT），探究苦荞HCT基因的表达调控以及对苦荞果壳发育形成的影响。运用RT-PCR技术克隆获得两条苦荞HCT基因，命名为FtHCT-1、FtHCT-2，对两基因编码蛋白进行生物信息学分析，对不同组织器官及果壳不同时期混合材料进行qRT-PCR表达分析。结果表明：FtHCT-1、FtHCT-2开放阅读框序列长度分别为1 347 bp、1 278 bp，各编码488和425个氨基酸，蛋白分子量分别为49.66 kD和46.57 kD，理论等电点为5.72和6.64，均为亲水性蛋白，处在细胞质内，均属于PLNO2481和Trasferase超家族，具有高度同源。两基因表达存在明显差异。本研究克隆所得两条HCT基因在苦荞果壳生长发育中特定表达，推断其表达影响苦荞果壳木质素合成，为薄果壳形成的关键基因。

• 单位
  山西中医药大学; 云南省农业生物技术重点实验室; 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所