基因表达谱富集分析方法研究进展

作者：曹文君; 李运明; 陈长生

来源：生物技术通讯, 2008, (06): 931-934.

• 基因表达谱
• 基因集
• 富集分析
• GeneOntology术语
• 统计推断 gene expression profiles
• gene set
• enrichment analysis
• Gene Ontology term
• statistical inference

微阵列技术是生物技术变革的核心,允许研究者同时监测成千上万个基因的表达水平,已广泛应用于医学研究。如何挖掘海量基因表达信息中的有用信息并进行生物学专业解释,是基因表达谱数据分析领域所面临的一个重要挑战。不同的研究者提出了各种基于基因集进行富集分析的方法,在此将这些方法大致分为两大类,即bottom-up方法和top-down方法。前者先进行单基因分析,然后根据生物学领域知识注释基因集并进行分析。该方法应用广泛,且结果比单基因分析容易解释。后者先根据生物学领域知识将各基因进行归类,然后进行基因差异表达模式分析。该方法不仅能提高结论的可解释性,而且能达到降维的目的。

• 单位
  第四军医大学