针对绿色背景下跨单元调度存在加工效率低和能源消耗高等问题，建立了以最小化完工时间和全局能耗的多目标数学模型。提出了一种改进变邻域NSGA-Ⅱ算法求解模型。首先引入三层编码表达问题特征，然后设计了考虑运输时间的解码方法，提出一种基于Sigmoid函数的自适应交叉变异率以保证种群多样性，最后构建了三种变邻域结构融入改进后的NSGA-Ⅱ算法来增强局部搜索能力。实验表明，改进后的算法能有效求解模型，运输时间能够协调完工时间和能耗关系。
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