青海省部分地区马铃薯Y病毒cp基因序列分析

作者：程亮

来源：浙江农业学报, 2019, 31(11): 1888-1895.

• 马铃薯Y病毒
• cp基因
• 序列分析
• 最大似然法
• 青海

马铃薯Y病毒(PVY)是危害我国马铃薯的主要病毒之一,其在自然条件下极易发生基因变异而产生株系分化现象。为揭示青海马铃薯Y病毒分离物cp基因的分子变异,利用RT-PCR方法扩增获得了16个马铃薯Y病毒分离物的cp基因序列,采用SDT、DANMAN、RDP和MEGA软件对其进行分子变异分析。序列一致率结果表明,16个分离物的核苷酸序列均为801个碱基,一致率为98.0%～100%,编码267个氨基酸,一致率为94.8%～100%。重组分析表明,16个分离物未发生基因重组。系统发育分析发现,11个分离物与PVYN-Wi株系相聚成簇,表明其在系统发育关系上与PVYN-Wi株系的亲缘关系最近,占被检出病毒分离物的68.7%;另外5个分离物与PVYO株系相聚成簇,表明其在系统发育关系上与PVYO株系亲缘关系最近;未发现PVYC株系、PVYN株系、PVYE株系和PVYNTN株系存在。

• 单位
  青海省农林科学院; 青海大学; 植物保护研究所